首先检查反渗透设备(系统)中所有阀门是否处在正常状态，特别要确认原水压力调节和浓水调节阀是否是完全打开状态。若是大型反渗透设备系统，首先检查反渗透设备中配置的电动阀或气动阀是否能根据程序上的操作开启或关闭。
当反渗透设备系统有原水供水泵为反渗透设备系统供水时，首先以低压、低流量对反渗透设备系统进行排气和冲洗。若反渗透系统中没有单独配置供水泵，则可利用反渗透设备系统所提供的原水进行低压冲洗膜内含有化学药品的保护液及空气，冲洗时间应控制在10~30分钟之间。进行冲洗操作时系统的运行压力最好控制在30~60psi左右，冲洗流量控制最好应能达到化学清洗时的建议运行流量值。冲洗产出水和浓缩水要排掉，注意浓水系统的浓水调节阀及并接在浓水出口的排放阀处于完全打开状态。在此过程中，还要注意检查反渗透设备管路连接状态及阀门有无漏水现象。